Gli organi della FGASI sono l'assemblea dei capigruppo, il comitato, la commissione tecnica e l'organo di revisione. A questi si aggiungono una serie di compiti di rappresentanza in seno alla Federazione Svizzera di aeromodellismo (FSAM) e agli Aero Club Locarno e Lugano.
 
L'organo supremo della FGASI è l'assemblea dei capigruppo, che ha potere decisionale. In seduta assembleare, i capigruppo (presidenti dei gruppi FGASI) rappresentano i membri affiliati al loro gruppo.
 
Il presidente FGASI è pure membro di diritto nel comitato FSAM. Questo è composto da presidente, cassiere, i presidenti delle commissioni tecniche nazionali e i presidenti delle nove associazioni regionali di aeromodellismo che costituiscono la Federazione Svizzera di aeromodellismo.
 
La FSAM, al fianco delle federazioni di categoria delle varie discipline aviatorie rappresentate, è parte integrante dell'Aero Club Svizzero.

struttura organizzativa dell'aeromodellismo